Ikke-udtømmende liste.

Eutrofiering er et betydeligt problem i Østersøen, forårsaget af overskydende næringsstoffer fra forskellige kilder, herunder landbrug, spildevand og industri. Dette fører til overdreven algespredning, som nedbryder ilten i vandet og dermed påvirker den marine flora og fauna.
,
Havforurening forbundet med industri og søtransport, der fører til udledning af skadelige stoffer såsom kulbrinter og tungmetaller, hvilket kræver streng styring og strengere miljøstandarder for at minimere disse påvirkninger.
 
Plastforurening i Østersøen, som følge af plastaffald, der skylles ud i floder og truer havets dyreliv. Foranstaltninger til at reducere plastik ved kilden sammen med genbrug og opmærksomhed er nødvendige for at løse dette problem.
 
Forsuring af Østersøen på grund af øget kuldioxidemission, skadelig for marine organismer og biodiversitet, hvilket understreger vigtigheden af ​​at reducere CO2-emissioner.
 
Forurening af kystnære farvande forårsaget af skibsfart og havneaktiviteter, der involverer brændstofudledning, utilsigtet udslip og spildevand. Renere havnepraksis og forebyggende foranstaltninger er afgørende for at afbøde disse påvirkninger.
 
Nedbrydning af kystnære økosystemer på grund af ureguleret byggeri, beskadigelse af følsomme naturlige levesteder, som kræver bæredygtig byplanlægning og strenge miljøbestemmelser.
 
Kemisk forurening fra industrielle aktiviteter, der forårsager udslip af tungmetaller, industrikemikalier og giftige stoffer i vand. Det er nødvendigt at styrke miljøbestemmelserne og behandle industriaffald for at reducere denne forurening.
 
Offshore olie- og gasaktiviteters indvirkning på marine økosystemer, hvor olielækager og olieudslip forårsager skade på marine habitater og biodiversitet, hvilket kræver høje sikkerhedsstandarder og katastrofeberedskab.
 
Overfiskeri er en yderligere udfordring, som truer havressourcernes bæredygtighed. Overudnyttelse af fiskebestande og andre marine arter kan føre til økologiske ubalancer, fald i fiskebestandene og negative økonomiske og sociale konsekvenser for samfund, der er afhængige af fiskeri. Bekæmpelse af overfiskeri kræver effektiv kvoteforvaltning, beskyttelse af havområder og fremme af bæredygtige fiskerimetoder for at bevare marine økosystemer på lang sigt.